Мы используем файлы cookie.
Продолжая использовать сайт, вы даете свое согласие на работу с этими файлами.

Синдекан 1

Синдекан 1
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
Символ SDC1 ; CD138; SDC; SYND1; syndecan
Внешние ID OMIM: 186355 MGI1349162 HomoloGene2252 GeneCards: SDC1 Gene
Профиль экспрессии РНК
PBB GE SDC1 201286 at tn.png
PBB GE SDC1 201287 s at tn.png
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 6382 20969
Ensembl ENSG00000115884 ENSMUSG00000020592
UniProt P18827 P18828
RefSeq (мРНК) NM_001006946 NM_011519
RefSeq (белок) NP_001006947 NP_035649
Локус (UCSC) Chr 2:
20.4 – 20.43 Mb
Chr 12:
8.77 – 8.79 Mb
Поиск в PubMed [1] [2]

Синдекан 1 (англ. syndecan 1; CD138) — мембранный белок, протеогликан семейства синдеканов, или трансмембранных гепарансульфатпротеогликанов. Всего описано 4 белка этого семейства. Продукт гена человека SDC1.

Функции

Белок является трансмембранным гепарансульфатпротеогликаном, входит в семейство синдеканов. Синдеканы опосредуют связывание клеток, передачу сигнала в клетке и организацию цитоскелета. Являются рецепторами для Tat-белка вируса ВИЧ. Синдекан 1 участвует в клеточной пролиферации, клеточной миграции и клеточном взаимодействии с белками внеклеточного матрикса.

Структура

Синдекан 1 несёт гепарансульфатные и хондроитинсульфатные цепи, которые обеспечивают связь цитоскелета с внеклеточным матриксом. Связывается с CDCP1.

Отщепление эктодомена приводит к образованию растворимой формы белка. Отщепление может происходить под действием гепараназы, тромбина и эпидермального фактора роста, а также при стрессе и в процессе заживления раны.

Белок состоит из 288 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 32.5 кДа. Включает N-концевой внеклеточный домен (232 аминокислоты), единственный спиральный трансмембранный фрагмент и небольшой цитозольный участок. На внеклеточном домене находится 6 участков гликозилирования: 3 участка присоединения O-хондроитинсульфатных цепей, 2 участка присоединения O-гепарансульфатных цепей и 1 участок N-гликозилирования. Цитозольный фрагмент содержит фосфорилируемый тирозин.

Применение

Синдекан 1 используется в качестве маркёра плазматических клеток, если известно, что клетки произошли из клеток крови.

См. также

Редактировать

Новое сообщение